【フルリモート／週5／Python】AI創薬・次世代バイオインフォマティクスプラットフォームのバックエンドエンジニア

お任せしたいこと

［役割］バックエンドエンジニアとして、膨大なゲノムデータやタンパク質構造データをAIで解析し、新薬開発（創薬）のプロセスを劇的に短縮・効率化する次世代バイオインフォマティクスプラットフォームの開発をお任せします。
［役割に対して求める成果］数テラバイトに及ぶ秘匿性の高い生命科学データや医療データをセキュアに管理し、バイオインフォマティシャンや研究者が開発した機械学習モデル（化合物探索、毒性予測など）をバックエンドシステムに統合して、スケーラブルかつ安定して計算処理を実行できる基盤を実現すること。

具体的な業務内容

・Python（FastAPI等）を用いた、研究者向けWebアプリケーションおよび外部連携APIの詳細設計・実装
・CeleryやRabbitMQ、AWS Batch等を利用した、大規模な分子シミュレーションや機械学習推論を伴う非同期・分散処理バックエンドの設計・開発
・Apache AirflowやNextflow等のワークフローエンジンを活用した、ゲノム解析・化合物データ前処理パイプラインの構築
・RDBMS（PostgreSQL等）およびNoSQL（MongoDB等）を用いた、複雑な階層構造を持つ生物学・化学データのモデリングとクエリチューニング
・高度なセキュリティ要件（HIPAAガイドラインや３省２ガイドライン等に準拠）を満たすデータアクセス制御・監査ログ基盤の実装
・Pytestを用いたテスト自動化と、計算機リソース（GPU/CPU）の利用効率を最大化するパフォーマンス・チューニング

必須スキル・経験

・Pythonを用いたWebアプリケーションまたはAPIの設計・開発経験（3年以上）
・FastAPI、DjangoなどのWebフレームワークを用いた実務経験
・RDBMSを用いたデータベース設計、トランザクション管理、およびSQLチューニングの経験
・非同期処理（Celery等）やバッチ処理システムの開発・運用経験
・Git/GitHubを用いたチーム開発およびPull Requestベースのコードレビュー経験

歓迎スキル・経験

・バイオインフォマティクス、ケモインフォマティクス（計算化学）、または創薬・医療ドメインに関する知識・開発経験
・RDKit等の化学情報学向けPythonライブラリの利用経験
・AWS（EKS, Batch, S3等）またはGCP環境でのコンテナ技術（Docker/Kubernetes）を利用したインフラ構築・運用経験
・大規模なデータパイプライン（Apache Airflow等）の構築・運用経験
・データサイエンティストや研究者との協業経験

開発環境

言語・フレームワーク：Python 3.1x, FastAPI, Celery, Pytest, SQLAlchemy
インフラ・ミドルウェア：AWS (EKS, Batch, RDS, S3, SQS), Docker, Kubernetes, PostgreSQL, MongoDB, Redis
ツール・その他：Apache Airflow, Nextflow, GitHub, GitHub Actions, Datadog, Jira, Slack

開発チームについて

プロダクトマネージャー1名、テックリード1名、バイオインフォマティクス研究者・計算化学者3名、バックエンドエンジニア5名（今回募集枠含む）、フロントエンドエンジニア3名、MLOpsエンジニア2名の体制です。「ITの力で難病を治す」というミッションのもと、生命科学の専門家とソフトウェアエンジニアが互いの専門知識を共有し合い、未知のアルゴリズムや複雑なデータ構造にチーム一丸となって取り組む研究開発色の強いカルチャーです。

求める人物像

・生物学や医療、創薬といった人類の未来に直結するディープテック領域に強い関心と知的好奇心を持てる方
・計算コストが高く、処理に数時間〜数日かかるような重厚なバッチ処理や分散処理のアーキテクチャ設計に泥臭く向き合える方
・フルリモート環境下において、研究者などバックグラウンドの異なる専門家とも自発的かつ円滑にテキストや通話でコミュニケーションが取れる方

仕事の魅力

通常であれば10年以上かかる新薬開発の期間を、テクノロジーの力で数年に短縮するという極めて社会的意義とインパクトの大きなプロダクトです。Pythonを用いたモダンなバックエンド開発に加え、AWS BatchやKubernetesを用いた大規模な分散コンピューティング、複雑な科学データのモデリングなど、一般的なWeb開発では経験できない高度でエッジの効いた技術課題に挑戦することで、エンジニアとしての市場価値を圧倒的に高めることができます。

働き方

リモート環境

[フルリモート] フルリモートで働いていただけます。